TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好。在预测miRNA靶基因之前,首先需要确定转录本的3’UTR区域,TargetScan数据库通过一种名为3...
TargetScan predicts biological targets of miRNAs by searching for the presence of conserved8mer,7mer, and6mersites that match theseed regionof each miRNA (Lewis e...
01 Targetscan靶向预测思想 TargetScan 基于序列互补原则,找到比对到靶 3'UTR 的保守性 8 mer、7 mer 或 6 mer 位点(seed match 序列),进一步根据热力学稳定性筛选得到 targe...
TargetScanFly TargetScanWorm TargetScanFish 在预测miRNA靶基因之前,首先需要确定转录本的3’UTR区域,该数据库通过一种名为3P-seq的测序技术,确定转录本对应的3’UTR区,该技术原...
http://www.targetscan.org/vert_71/ 最新版本为release 7.1, 2016年6月更新,在该数据库中,提供了多种哺乳动物的miRNA 靶基因预测结果: 1)Human : 人 2) Mouse : 小鼠 3) Rat : 大...
miRNA_family文件可以在targetscan官网下载:miRNA_family_info.txt step 1、首先需要准备两个文件:miRNA 的 fa 序列以及 target 的 fa 序列文件。 step 2、将上...
一、浏览器搜索TargetScan.org/vert 7.1进入官网 物种收录包括人,大鼠,小鼠,线虫,果蝇,斑马鱼,牛,狗,鸡等。 选择物种,输入基因名字miR-21-5p(以下输入位置均在红色方框内表示),点击...
TargetScan 数据库简介 TargetScan 是一个miRNA 靶基因预测的网站, 包括了 人, 小鼠,果蝇 , 线虫, 斑马鱼 共5个物种的miRNA 靶基因结果, 人 : TargetScanHuman 小鼠 :TargetS...
microRNA靶基因预测分析工具targetscan使用说明 ^TargetScanMouse J^^Predlcll?u>f mfcroRNA targets Release 7.1 Jonvary 20U Agcxwal el aL. 2015 Search...
收录于:2023-02-24 02:50:14